Nouvèl

Imite kondisyon fizyolojik ede chèchè jwenn atach metal yo

Chèchè yo te devlope yon metòd pou idantifye ti molekil ki mare iyon metal yo. Iyon metal yo esansyèl nan byoloji. Men, idantifye ki molekil-e sitou ki ti molekil-yo metal iyon sa yo kominike avèk yo ka difisil.

Pou separe metabolit pou analiz, metòd metabolomik konvansyonèl yo sèvi ak solvang òganik ak pH ki ba, sa ki ka lakòz konplèks metal yo disosye. Pieter C. Dorrestein nan University of California San Diego ak kòlèg travay yo te vle kenbe konplèks yo ansanm pou analiz pa imite kondisyon natif natal yo te jwenn nan selil yo. Men, si yo te itilize kondisyon fizyolojik pandan separasyon molekil yo, yo ta dwe reoptimize kondisyon separasyon yo pou chak kondisyon fizyolojik yo te vle teste.

Olye de sa, chèchè yo devlope yon apwòch de etap ki entwodui kondisyon fizyolojik ant yon separasyon kwomatografik konvansyonèl ak yon analiz mas spectrometric (Nat. Chem. 2021, DOI: 10.1038/s41557-021-00803-1). Premyèman, yo separe yon ekstrè byolojik lè l sèvi avèk konvansyonèl segondè-pèfòmans likid chromatografi. Lè sa a, yo ajiste pH koule a soti nan kolòn chromatographic imite kondisyon fizyolojik, ajoute iyon metal, epi analize melanj lan ak espektrometri mas. Yo te kouri analiz la de fwa pou jwenn spectre mas nan molekil ti ak ak san metal. Pou idantifye ki molekil ki mare metal yo, yo te itilize yon metòd enfòmatik ki itilize fòm pik pou dedwi koneksyon ant spèkt vèsyon ki mare ak vèsyon ki pa lie.

Yon fason pou plis imite kondisyon fizyolojik, Dorrestein di, ta dwe ajoute konsantrasyon segondè nan iyon tankou sodyòm oswa potasyòm ak konsantrasyon ki ba nan metal la nan enterè yo. "Li vin tounen yon eksperyans konpetisyon. Li pral fondamantalman di ou, OK, molekil sa a nan kondisyon sa yo gen plis tandans pou liye sodyòm ak potasyòm oswa metal inik sa a ke ou te ajoute," Dorrestein di. "Nou ka pénétrer anpil metal diferan ansanm, epi nou ka reyèlman konprann preferans ak selektivite nan kontèks sa a."

Nan ekstrè kilti soti nan Escherichia coli, chèchè yo te idantifye konpoze fè-obligatwa li te ye tankou yersiniabactin ak aerobactin. Nan ka a nan yersiniabactin, yo te dekouvri ke li kapab tou mare zenk.

Chèchè yo te idantifye konpoze metal-obligatwa nan echantiyon yo konplèks tankou matyè òganik ki fonn nan oseyan an. "Sa se absoliman youn nan echantiyon ki pi konplèks mwen te janm gade," Dorrestein di. "Li pwobableman osi konplèks ke, si se pa pi konplèks pase, lwil brit." Metòd la te idantifye asid domoik kòm yon molekil kòb kwiv mete ak sijere ke li mare Cu2+ kòm yon dim.

"Yon apwòch omik pou idantifye tout metabolit metal-obligatwa nan yon echantiyon trè itil akòz enpòtans ki genyen nan chelation metal byolojik," Oliver Baars, ki etidye metabolit metal-obligatwa ki te pwodwi pa plant ak mikwòb nan North Carolina State University, ekri nan yon imel.

"Dorrestein ak kòlèg travay yo bay yon tès elegant, ki nesesè anpil pou pi byen sonde ki sa wòl fizyolojik iyon metal yo nan selil la ta ka," Albert JR Heck, yon pyonye nan analiz spectrometri mas natif natal nan Inivèsite Utrecht, ekri nan yon imèl. "Yon pwochen etap posib ta dwe ekstrè metabolit yo nan kondisyon natif natal nan selil la ak fraksyon sa yo tou nan kondisyon natif natal, yo wè ki metabolit ki pote ki iyon metal selil andojèn."

Tan poste: Dec-23-2021